Expediente N⁰ PI13/02501 

Projekt finansowany przez Institute of Health Carlos III w Hiszpanii i realizowany przez Molecular Biology and Research Section, Szpitala Verge de la Cinta w Tortozie (1.01.2014 r. do 31.12.2016 r.)

Kierownik projektu: dr Merylene Lejeune

Koordynator IBIB PAN: dr Anna Korzyńska

Cel główny: Potrójnie negatywny rak sutka (TNBC) jest jednym z podtypów raka z mniejszą przeżywalnością i mniejszą ilościom dostępnych terapii, a 50% pacjentów z tą chorobą doświadcza wznowy w ciągu 3-5 lat. W przybliżeniu u 50% pacjentów ze stwierdzonym TNBC nie stwierdza się całkowitej odpowiedzi patologicznej (pCR) na neoadjuwantową chemioterapię (NAC). Nowotwór TNBC cechuje się 6 razy większym prawdopodobieństwem wznowy i 12 razy większym prawdopodobieństwem śmierci w porównaniu do innych typów nowotworów z całkowitą odpowiedzią patologiczną pCR. Tkanka nowotworowa i otaczając ją zdrowa tkanka, zwana mikrośrodowiskiem nowotworu, przyczynia się zarówno do rozwoju nowotworu, jak i do jego wznowy. Leczenie cytotoksyczne wpływa na tak rozumiane mikrośrodowisko. Celem projektu jest znalezienie charakterystyki mikrośrodowiska nowotworu w postaci wzorca obecności komórek układu odpornościowego i wybranych częstek/molokuł pozwalających na ocenę prawdopodobieństwa wznowy w TNBC leczonym NAC z pCR.

Metodologia: Badania będą przeprowadzone na 223 pacjentach ze zdiagnozowanym w latach 2008 - 2013 inwazyjnym TNBC, bez dalszych przerzutów, leczonych NAC i monitorowanych przez 3 lata od dnia operacji aż do wznowy (grupa badawcza) albo końca kontroli (grupa kontrolna). Markery będą wskazywały obecność komórek układu odpornościowego i innych wybranych molekuł w mikrośrodowisku nowotworu. Badania będą przeprowadzone na podstawie chirurgicznych biopsji tkanek barwionych immunohistochemicznie oraz stosując hybrydyzacje RNA z użyciem mikromacierzy. Obrazy tkanek będą analizowane z wykorzystaniem procedur cyfrowej analizy obrazu. Różnice w obecności wybranych komórek układu odpornościowego i wybranych molekuł będą analizowane z użyciem porównań statystycznych między odpowiednio dobranymi grupami.

Przyszłe zastosowania: Znalezione różnice we wzorcu obecności wybranych komórek układu odpornościowego i wybranych cząsteczek mogą stać się wzorcami predykcyjnymi, pozwalającymi identyfikować pacjentów o podwyższonym ryzyku wznowy. Wyniki projektu mogą prowadzić do sformułowania nowych wytycznych dotyczących kuracji pacjentów z grupy o wysokim ryzyku wznowy oraz do zaprojektowania nowych procedur diagnostycznych, nakierowanych na analizę wzorca odpowiedzi odpornościowej w tkance nowotworowej i otaczającej ją zdrowej tkance.

Część projektu realizowana w IBIB PAN przez pracownię SPIMO to przygotowanie zautomatyzowanej procedury analizy markerów jądrowych i analiza ilościowa przekazanych obrazów.